Kembali ke nama jembatan, setelah dilakukan perbaikan (1665), VOC memberikan nama baru, yakni Het Middlepunt Brug (Jembatan Pusat), karena letaknya ketika itu di pusat Kota Batavia. Namun, bagi masyarakat setempat lebih akrab dengan nama Jembatan Ayam karena di sekitarnya terdapat pasar ayam. Namun, ada juga yang berpendapat pasar ayam yang dimaksud adalah "kupu-kupu malam".
Masih nama jembatan. Pada 1938, Ratu Juliana--ibu Ratu Beatrix--menikah dengan Raja Bernard. Namanya menjadi Jembatan Juliana-Bernard.
Nama jembatan Kota Intan diperkenalkan sejak Indonesia merdeka dan disesuaikan dengan lokasi jembatan yang berada di kawasan Kastil Batavia yang bernama diamond (intan).
Menyusuri Ciliwung dari jembatan ini ke arah utara, terletak pelabuhan Sunda Kelapa--merupakan cikal bakal Kota Jakarta yang sarat dengan nilai sejarah. Bahkan, jauh melampaui keberadaan Kota Jakarta (sekitar abad ke-16).